Das SOS-Kinderdorf Rafah liegt ca. 15 km von Rafah entfernt in einem Ort namens „Deir Sultan“. Es umfasst vierzehn Familienhäuser, Dorfleiterhaus, Personalunterkünfte, Tanten- und Gästehaus (SOS-Tanten kümmern sich in Abwesenheit der SOS-Mütter um die Kinder), ein Gemeinschaftshaus und eine Nothilfekrankenstation. Im Jahr 2000 wurde dem SOS-Kinderdorf ein SOS-Kindergarten mit einer Kapazität von 360 Plätzen angeschlossen. Er besteht aus sechs Gruppenräumen und zwei Spielplätzen. Im Februar 2006 wurde das SOS-Kinderdorf um ein Jugendhaus für Mädchen erweitert, in dem, je nach Bedarf, bis zu sieben Mädchen untergebracht werden können.
Im September 2004 wurde in Khan Younis ein zweiter SOS-Kindergarten eröffnet, in dem vorwiegend Kinder aus der Stadt Khan Younis, die in der Nähe von Rafah liegt, betreut werden. Der SOS-Kindergarten, der für etwa 160 Kinder Platz bietet, umfasst vier Gruppenräume, einen Computerraum und einen Garten.
Da es in der Umgebung des SOS-Kinderdorfes kaum Bildungseinrichtungen gibt, wurde 2001 eine SOS-Hermann-Gmeiner Primarschule errichtet. Zurzeit werden insgesamt 150 Schüler in acht Klassen unterrichtet. Ein Spielplatz wurde ebenfalls eingerichtet. Sowohl die SOS-Kindergärten als auch die SOS-Hermann Gmeiner Primarschule werden von SOS-Kinderdorfkindern und von Kindern aus der Nachbarschaft besucht.
Das SOS-Sozialzentrum (SOS Zentrum für Soziale Ressourcen und Ausbildung) wurde im April 2005 eröffnet. In diesem Zentrum werden von Universitätsprofessoren Computer- und Sprachkurse für Studenten (zurzeit etwa 2800) der lokalen Universitäten abgehalten. Das SOS-Sozialzentrum wurde auch mit einer kleinen medizinischen Nothilfestation ausgestattet.